服用纯天然的EE型鱼油胶囊具有降低血压的效果，但是如果此时正在服用降压药物，服用的EE型鱼油胶囊数量过高，也有可能会形成低血压。有出血性疾病和出血倾向者禁用纯天然的EE型鱼油胶囊。对鱼和海鲜有过敏症状的人，服用EE型鱼油胶囊可能会出现过敏症状，如果出现过敏反应，要立即停止服用EE型鱼油胶囊。如果正处于怀孕或哺乳期、面临手术、有出血问题或进行任何其他处理，可能影响血液凝块的能力，服用前要咨询医生。肝病患者代谢功能较差，服用前需咨询医生的意见。

选小鱼不选大鱼：好的纯天然的EE型鱼油胶囊，其原料采用的是食物链低端的鱼类：anchovy（鳀鱼），鳕鱼，鲭鱼和沙丁鱼。因为小鱼寿命短，所以对海洋中的有害物质也吸收的较少。如果能买到鳀鱼和沙丁鱼的鱼油好，其次是鳕鱼油和三文鱼油。选无腥臭：海鱼不可避免的有鱼腥的味道，但是EE型鱼油胶囊只有在品质下降和酸败过程中才会有难闻的气味。且高质量的大同EE型鱼油胶囊海洋鱼油补充剂，拥有高水准的脱腥除臭技术。不选人工调味产品：不要选择那些有强烈人工调味的EE型鱼油胶囊鱼油产品，因为厂家可能会为了掩盖酸败气味而加入人工香料。

据外媒报道，众所周知，富含鱼类的饮食对心脏健康有一定的好处，但对服用各种纯天然的EE型鱼油胶囊和omega-3保健品的好处还存在疑虑。一项新的分析发现，服用EE型鱼油胶囊虽然可能对人的心血管健康有着重要的保护作用，但存在一个问题：研究结果是基于服用一种高度提纯的纯天然的EE型鱼油胶囊，然而这种EE型鱼油胶囊在柜台上是买不到的。这项统计分析来自加州大学欧文分校，其预测，使用高度纯化的纯天然的EE型鱼油胶囊可能对预防危险的心血管疾病如中风和心脏病发作有深远的影响。

研究者开发了一种自乳化的药物运输系统（SEDDS，self-emulsifying drug delivery system）—AquaCelle Omega-3 EE，在随机双盲试验中，研究者发现，当服用AquaCelle产品后，患者对纯天然的EE型鱼油胶囊的吸收水平增加了6倍；研究者招募了60名参与者进行单次680mg胶囊剂量的试验，这些胶囊中含有EPA和DHA乙酯（omega 3s），成分中含有或不含AquaCelle。研究者发现，当摄入含有乳化剂的胶囊后，AquaCelle组参与者机体纯天然的EE型鱼油胶囊的吸收和血浆浓度都会明显升高。